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Microscópio muito poderoso que usa elétrons para observar átomos. Um microscópio de tunelamento tem uma agulha eletrificada finíssima que varre uma superfície, a pequena distância. Os elétrons fluem, ou tunelam, entre a ponta da agulha e os átomos na superfície. A ponta sobe e desce para manter o fluxo de elétrons constante, e portanto segue o contorno dos átomos da superfície. Um computador então produz uma imagem dos átomos.
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